با توجه به تغییرات زیست محیطی و آلودگی آب ها، امروزه تغییرات شدید عوامل محیطی به عنوان مهمترین علل ایجاد تلفات ماهیان به حساب می آیند. در این رابطه در سیستم های گرمابی، کمبود اکسیژن ، تغییرات پ-اچ، کود پاشی غیر اصولی، شکوفایی جلبک های مضر، تجمع لجن و گازهای سمی در بستر و بسیاری عوامل دیگر مطرح هستند. دامپزشکان عمومی غالباً در ارتباط با بسیاری از مباحث محیطی از توانایی مطلوب برخوردار نیستند و آشنایی کافی با فاکتورهای از قبیل هدایت الکتریکی، قابلیت اکسیداسیون آب ، BOD، جلبک های سمی، سیانوباکتریها و نحوه تکثیر آنها ندارند. در این دوره به نقش این عوامل و نحوه تنظیم آنها پرداخته خواهد شد.